Laboratorio de Bioinformática y Expresión Génica

El Laboratorio de Bioinformática y Expresión Génica (LBEG) fue creado en el año 2003 con el objetivo de establecer un programa de investigación que abordara preguntas biológicas fundamentales a nivel de los genes, considerando su expresión dentro de un contexto genómico y explorando la funcionalidad de ellos a nivel celular y sistémico. El análisis de los genomas y de las formas por las cuales los productos de los genes interactúan en complejas redes, ha representado una revolución en las ciencias de la vida. Esta concepción pretende entender el funcionamiento de los organismos en sus múltiples niveles de organización (biología de sistemas).

Los científicos del LBEG con una sólida formación en biología celular y molecular contribuyen a este programa de investigación a través de proyectos de investigación básica y aplicada. Los modelos experimentales son eucariontes (insectos y cultivos celulares) y organismos procariontes. Las tecnologías aplicadas incluyen, genómica, bioinformática y genética molecular. Los investigadores del LBEG han participado desde el año 2003 en los programas genómicos nacionales apoyando, desde la investigación básica, el desarrollo de tecnologías en sectores fundamentales de nuestra economía.

Integrantes

Coordinadora

• Dra. Verónica Cambiazo A.
  Profesora titular

Académicos 

• Dr. Mauricio González 
  Profesor Titular
• Dr. Christian Hodar
  Profesor asistente
• Dra. Javiera Ortiz-Severin
  Profesora asistente 
• Dr. Mauricio Latorre
  Profesor adjunto

Líneas de Investigación

Microbiología de suelos del desierto de Atacama e interacción microbioma-plantas: En la actualidad los científicos del LBEG abordan la investigación de los microorganismos en sus entornos naturales, con el objetivo de describir la microbiota presente, estudiar las interrelaciones de los microorganismos con las condiciones físicas y químicas de su ambiente, así como entre ellos y con otros componentes bióticos.

Nutrición molecular, homeostasis celular de cobre, hierro y zinc: Esta línea de investigación aborda el estudio de los mecanismos celulares que controlan la absorción, el almacenamiento y la salida de Cu, Fe o Zn y que mantienen la homeostasis después de una exposición aguda o crónica al metal, así como la caracterización de las redes regulación génica que controlan la adaptación celular a la exposición a metales. 

Genómica de las interacciones patógeno-hospedero: En esta línea de investigación el interés está centrado en el estudio de las interacciones patógeno-hospedero entre salmón del Atlántico (Salmo salar) y Piscirickettsia salmonis. Nuestro objetivo es comprender la compleja relación que se establece entre la bacteria y su célula hospedera, utilizando herramientas de la genómica funcional, secuenciación de genomas completos de diferentes cepas del patógeno y análisis comparativos de genomas y transcriptomas. 

Impacto de la acuicultura sobre el microbioma marino: Esta línea de investigación estudia cómo la producción acuícola afecta el riesgo de propagación de factores de virulencia y de resistencia a antibióticos de los microorganismos marinos. así como su incidencia en la aparición de enfermedades alimentarias emergentes, con un enfoque que considera las conexiones entre el medio ambiente, la salud animal y la humana.

Redes de regulación génica que controlan el desarrollo, la evolución y las interacciones entre especies: Esta línea de investigación analiza y compara el desarrollo temprano de especies de dípteros como organismos modelos, utilizado la bioinformática y distintas estrategias para medir cambios de expresión génica. Recientemente, nuevas interrogantes acerca de la evolución de genomas como mecanismo de adaptación al ambiente, han sido abordadas utilizando modelos de peces provenientes de ambientes extremos o con ciclos de vida particulares. 

Virulencia bacteriana y resistencia a antibióticos en modelos alternativos de infección: Esta línea estudia la interacción entre bacterias patógenas y algunos hospederos simples o alternativos, como la ameba (Dictyostelium discoideum) y el pez cebra (Danio rerio). Considerando que muchos de los factores de virulencia bacterianos son evolutivamente conservados, el uso de hospederos simples permite estudiar los factores genéticos del hospedero y de los microorganismos relevantes para el desarrollo de enfermedades.

Biología de Sistemas aplicada al estudio de redes biológicas en organismos procariontes y eucariontes: La línea busca entender cómo los organismos coordinan a escala global su respuesta transcripcional y metabólica frente a la exposición a diferentes estímulos. En particular estamos estudiando modelos bacterianos patógenos, tales como Enterococcus faecalis, Streptococcus y Listeria monocytogenes. A nivel de organismos superiores, pretendemos generar conocimiento en el campo de la biomedicina, generamos modelos de redes biológicas de enfermedades cardiovasculares, síndrome de Down, Alzheimer, envejecimiento, enfermedad celíaca, hígado graso y obesidad.

Proyectos de Investigación

Millennium Institute Center for Genome Regulation (IMCRG)

• Director: Miguel Allende
• Investigadores principales: Drs. Mauricio González y Verónica Cambiazo
• Fuente de financiamiento: Millennium Institute Project ICN2021_044
• Periodo: 2022-2031
• Monto: $850.000.000.-/año

Antarctic microbiology of climate change: unearthing unknown virulence and resistance genes

• Director: Milko Jorquera
• Investigadora principal: Dra. Verónica Cambiazo
• Fuente de financiamiento:  ANID. Anillo ACT20210044. 2022-2025
• Periodo: 2022-2025
• Monto: $450.000.000.-

Systems Biology Center for the study of extremophile communities from mining tailings

• Director: Dr. Mauricio Latorre
• Fuente de financiamiento:  ANID. Anillo ACT210004. 2022-2025
• Periodo: 2022-2025
• Monto: $450.000.000.-

Fortalecimiento de la investigación en microbiología e inocuidad alimentaria: impacto de la acuicultura en la virulencia y resistencia a antibióticos en microorganismos ambientales

• Código: SA77210027
• Patrocinante: Dra. Verónica Cambiazo. Beneficiaria. Dra. Javiera Ortiz-Severin
• Entidad Financiadora:  ANID. Convocatoria Nacional Subvención a la Instalación en la Academia 2021
• Fuente de financiamiento:  2021-2024
• Monto: $181.307.313.-

The biphasic life style of Piscirickettsia salmonis: understanding its consequences for bacterial virulence

• Investigadora principal: Dra. Verónica Cambiazo
• Co-investigadores: Drs. Christian Hodar, Mauricio González y Mario Tello
• Fuente de financiamiento:  ANID. Anillo Fondecyt N° 1211893
• Periodo: 2021-2025
• Monto: $216.448.000.-

Estudio de la participación de la proteína transmembrana Patched-related en el mecanismo de guía axonal embrionaria de Drosophila melanogaster

• Fuente de financiamiento: CSIC I+D 313
• Periodo: 2021-2022
• Monto: $50.000.000.-

Center for Genome Regulation (CGR)

• Director:  Miguel Allende
• Investigador principal: Dr. Mauricio González
• Investigadora Asociada: Dra. Verónica Cambiazo
• Fuente de financiamiento: ANID/FONDAP/15200002
• Periodo: 2020-2021
• Monto: $450.000.000.-

Structural and functional analysis of microbiome changes between bulk soil and rhizosphere surrounding soil at different vegetation belts along an altitudinal gradient in the Andes of Atacama Desert

• Investigador principal: Dr. Mauricio González
• Co-investigadora: Dra. Verónica Cambiazo 
• Fuente de financiamiento: Fondecyt 1201278
• Periodo: 2020 -2024
• Monto: $253.934.000.-

Non-coding RNA global transcriptional regulatory network in Enterococcus faecalis

• Investigador principal: Dr. Mauricio Latorre
• Fuente de financiamiento:ANID. Fondecyt N°1190742
• Periodo: 2019-2023
• Monto: $240.000.000.-

RCAN1 trisomy and the control of PINK1 levels in the survival of human Down's syndrome induced pluripotent stem cells (iPSC) and iPSC-derived cardiomyocytes

• Co-Investigador: Dr. Mauricio Latorre
• Fuente de financiamiento: ANID. Fondecyt N°1190743
• Periodo: 2019-2023
• Monto: $240.000.000.-

Kit de detección molecular de microorganismos contaminantes del vino para uso en campo

• Directora: Dra. Verónica Cambiazo
• Fuente de financiamiento: Corfo 19CV-107317
• Periodo: 2018-2021
• Monto: $158.160.000.-

Synergistic transcriptional response of Listeria monocytogenes to low temperature and copper

• Co-Investigador: Dr. Mauricio Latorre
• Fuente de financiamiento: ANID. Fondecyt N°1171575
• Periodo: 2017-2019
• Monto: $180.000.000.-

Comparative and functional genomic analysis of the interaction between P. salmonis and its host-cell. 2016-2020

• Investigadora principal: Dra. Verónica Cambiazo
• Co-investigadores: Drs. Mauricio González y Alejandro Maass
• Fuente de financiamiento: Fondecyt Nº 1160802
• Periodo: 2016-2020
• Monto: $250.000.000.-

Metal metabolism in soil bacterial communities from an extreme environment: a comparative genomics analysis

• Investigador principal: Dr. Mauricio González
• Co-investigadores: Drs. Verónica Cambiazo y Alejandro Maass
• Fuente de financiamiento: Fondecyt 1151384
• Periodo: 2015 -2019 
• Monto: $216.000.000.-

PCR multiplex en tiempo real para la detección, identificación y cuantificación de microorganismos contaminantes del vino

• Directora: Dra. Verónica Cambiazo
• Co-director: Dr. Rodrigo Pulgar
• Periodo: 2014-2017
• Fuente de financiamiento:  XII Concurso Nacional de proyecto, Fundación COPEC-PUC, 2014.R.297
• Monto: $122.914.000.-

Sistema de bio-identificación molecular de microorganismos contaminantes durante el proceso de elaboración del vino. CORFO-Innova 14IDL2-29912. 2014-2017

• Directora: Dra. Verónica Cambiazo
• Co-investigadores: Drs. Mauricio González, Alejandro Maass y Rodrigo Pulgar
• Periodo: 2014-2017
• Fuente de financiamiento: CORFO-Innova 14IDL2-29912
• Monto: $140.563.400.-

Center for Genome Regulation (CGR)

• Director: Miguel Allende
• Investigador principal: Dr. Mauricio González
• Investigadora Asociada: Dra. Verónica Cambiazo
• Fuente de financiamiento: FONDAP 15090007
• Periodo: 2011-2020
• Monto: $900.000.000.-/año

Artículos 

1. Bolatto, C.; Nieves, S.; Reyes A.; Olivera-Bravo, S.; Cambiazo, V. 2022. Patched-related is required for proper development of embryonic Drosophila nervous system. Front Neurosci. 16: 920670. 
2. Galvez G, Ortega J, Fredericksen F, Aliaga-Tobar V, Parra V, Reyes-Jara A, Pizarro L, Latorre M. 2017. Co-occurrence Interaction Networks of Extremophile Species Living in a Copper Mining Tailing. Front Microbiol. 12: 791127. 
3. Gaete, A.; Andreani-Gerard, C.; Maldonado, J.E.; Muñoz-Torres, P.A.; Sepúlveda-Chavera, G.F.; González, M. 2022. Bioprospecting of Plant Growth-Promoting Traits of Pseudomonas sp. Strain C3 Isolated from the Atacama Desert: Molecular and Culture-Based Analysis. Diversity. 14: 388. 
4. Aguila-Torres P, González M, Maldonado J, Miranda R, Zhang L, González-Stegmaier R, Martin C. Rojas LA, Gaete A. 2022. Associations between bacterial communities and microplastics from surface seawater of the Northern Patagonian area of Chile. Environ Pollut. 306: 119313. 
5. Vásquez L, Parra A, Quesille-Villalobos AM, Gálvez G, Navarrete, P, Latorre M, Toro M, González M, Reyes-Jara. 2022. Cobalamin cbiP mutant shows decreased tolerance to low temperature and copper stress in Listeria monocytogenes. Biol. Res. 55: 9. 
6. Maldonado J, Gaete A, Mandakovic D, Aguado-Norese C, Melissa A, Gutiérrez R, González M. 2022. Partners to survive: H. doellii root-associated microbiome at the Atacama Desert. New Phytologist 34: 2126-2139. 
7. Battistoni B, Salazar J, Vega W, Valderrama-Soto D, Jiménez-Muñoz P, Sepúlveda-González A, Ahumada S, Cho I, Gardana C, Morales H, Peña Á, Silva H, Maldonado J, González M, Infante R and Pacheco I. 2022. An upgraded, highly saturated linkage map of the japanese plum (Prunus salicina Lindl.), and the identification of a new major locus controlling the flavan-3-ol composition in fruits. Front. Plant Sci. 13: 805744.
8. Di Genova A, Nardocci G, Maldonado-Agurto R, Hodar C, Valdivieso C, Morales P, Gajardo F, Marina R, Gutiérrez RA, Orellana A, Cambiazo A, Gonzalez M, Glavic A, Mendez M, Maass A, Allende ML, Montecino MA. 2022. Genome sequencing and transcriptomic analysis of the Andean killifish Orestias ascotanensis reveals adaptation to high-altitude aquatic life. Genomics. 114: 305-315. 
9. Marcoleta AE, Varas MA, Costa J, Rojas-Salgado J, Arros P, Berríos-Pastén C, Tapia S, Silva D, Fierro J, Canales N, Chávez FP, Gaete A, González M, Allende M, Lagos R. 2022. The highly diverse Antarctic Peninsula soil microbiota as a source of novel resistance genes. Sci Total Environ. 810: 152003. 
10. Ortiz-Severín J, Tandberg JI, Winther-Larsen HC, Chávez FP, Cambiazo V. 2021. Comparative analysis of salmon cell lines and zebrafish primary cell cultures infection with the fish pathogen Piscirickettsia salmonis. Microorganisms. 9:2516. 
11. Eshel G, Araus V, Undurraga S, Soto D, Moraga C, Montecinos A, Moyano T, Maldonado J, Díaz F, Varala K, Nelson ChW, Contreras-López O, Pal-Gabor H, Kraiser T, Carrasco-Puga G, Nilo R, Zegar ChM, Orellana A, Montecinos M, Maass A, Allende M, DeSalle R, Stevenson DW, González M, Latorre C, Coruzzi GC, Gutiérrez RA. 2021. Plant ecological genomics at the limits of life in the Atacama Desert. PNAS USA. 18: e2101177118. 
12. Valderrama D, Salazar J, Sepúlveda-González A, Silva-Andrade C, Gardana C, Morales H, Battistoni B, Jiménez-Muñoz P, González M, Peña-Neira A, Infante R, Pacheco I. 2021.  Detection of quantitative trait loci controlling the content of phenolic compounds in an Asian plum (Prunus salicina L.) F1 population. Front. Plant Sci. 12:1331.
13. Gaete A, Pulgar R, Maldonado J, Hodar Ch, Zamorano D, Pavez L, Pastenes C, Gonzalez M, Mandakovic D. 2021. Tomato cultivars with variable tolerances to water deficit differentially modulate the composition and interaction patterns of their rhizosphere microbial communities. Front. Plant Sci. 12: 688533.
14. DebRoy S, Aliaga-Tobar V, Galvez G, Arora S, Liang X, Horstmann N, Maracaja-Coutinho V, Latorre M, Hook M, Flores AR, Shelburne SA. 2021. Genome-wide analysis of in vivo CcpA binding with and without its key co-factor HPr in the major human pathogen group A Streptococcus. Mol Microbiol. 115: 1207-1228.
15. Ortiz-Severín J, Stuardo CJ, Jiménez NE, Palma R, Cortés MP, Maldonado J, Maass A, Cambiazo V. 2021. Nutrient scarcity in a new defined medium reveals metabolic resistance to antibiotics in the fish pathogen Piscirickettsia salmonis. Front Microbiol. 12:734239. 
16. Leskow CC, Conte M, Del Pozo T, Bermúdez L, Lira BS, Gramegna G, Baroli I, Burgos E, Zavallo D, Kamenetzky L, Asís R, Gonzalez M, Fernie AR, Rossi M, Osorio S, Carrari F. 2021. The cytosolic invertase NI6 affects vegetative growth, flowering, fruit set and yield in tomato. J Exp Botany. 72: 2525-2543 
17. Ortiz-Severín J, Travisany D, Maass A, Cambiazo V, Chávez FP. 2020. Global proteomic profiling of Piscirickettsia salmonis and salmon macrophage-like cells during intracellular infection. Microorganisms. 8:1845. 
18. Travisany D, Goles E, Latorre M, Cortés MP, Maass A. 2020. Generation and robustness of Boolean networks to model Clostridium difficile infection. Nat. Comput. 19: 111-134. 
19. Mandakovic D, Pulgar R, Maldonado J, Mardones W, González M, Cubillos FA, Cambiazo V. 2020. Fungal diversity analysis of grape musts from central Valley-Chile and characterization of potential new starter cultures. Microorganisms. 8: E956. 
20. Aravena P, Pulgar R, Ortiz-Severín J, Maza F, Gaete A, Martínez S, Serón E, González M, Cambiazo V. 2020. PCR-RFLP detection and genogroup identification of Piscirickettsia salmonis in field samples. Pathogens. 9: E358. 
21. Gaete A, Mandakovic D, González M. 2020. Isolation and identification of soil bacteria from extreme environments of Chile and their plant beneficial characteristics. Microorganisms. 8: E1213. 
22. Vásquez-Dean J, Maza F, Morel I, Pulgar RE, Gonzalez M. 2020. A systematic review of soil bacterial communities from arid environments at a global-scale. Biol. Res. 53: 29
23. Aguila-Torres P, Maldonado J, Gaete A, Figueroa J, González A, Miranda R, González-Stegmaier R, Martin C, González M. 2020. Biochemical and genomic characterization of the cypermethrin-degrading and biosurfactant-producing bacterial strains isolated from marine sediments of the Chilean Northern Patagonia. Marine Drugs. 18: 252 
24. Mandakovic D, Cintolesi A, Maldonado J, Mendoza S, Aite M, Gaete A, Saitua F, Allende M, Cambiazo V, Siegel A, Maass A, Gonzalez M, Latorre M. 2020. Genome-scale metabolic models of Microbacterium species isolated from a high altitude desert environment. Sci Rep. 10:5560. 
25. Miranda S, Vilches P, Suazo M, Pavez L, García K, Méndez M, González M, Meisel L, Defilippi BG; del Pozo T. 2020. Melatonin triggers metabolic and gene expression changes leading to improved quality traits of two sweet cherry cultivars during cold storage. Food Chem. 319:126360.
26. Zúñiga A, Aravena P, Pulgar R, Travisany D, Ortiz-Severín J, Chávez FP, Maass A, González M, Cambiazo V. 2020. Transcriptomic changes of Piscirickettsia salmonis during intracellular growth in a salmon macrophage-like cell line. Front Cell Infect Microbiol. 9:426.
27. Ortiz-Severín J, Travisany D, Maass A, Chávez FP, Cambiazo V. 2019. Piscirickettsia salmonis cryptic plasmids: source of mobile DNA and virulence factors. Pathogens. 8: E269.
28. del Pozo T, Miranda S, Latorre M, Olivares F, Pavez L, Gutiérrez R, Maldonado J, Hinrichsen P, Defilippi B, Orellana A, Gonzalez M. 2019. Comparative transcriptome profiling in a segregating peach population with contrasting juiciness phenotypes. J Agric Food Chem. 67: 1598-1607. 
29. Khan A, Davlieva M, Panesso D, Rincon S, Miller WR, Diaz L, Reyes J, Cruz MR, Pemberton O, Nguyen AH, Siegel SD, Planet PJ, Narechania A, Latorre M, Rios R, Singh KV, Ton-That H, Garsin DA, Tran TT, Shamoo Y, Arias CA. 2019. Antimicrobial sensing coupled with cell membrane remodeling mediates antibiotic resistance and virulence in Enterococcus faecalis. PNAS USA. 116: 26925-32.
30. Quesille-Villalobos AM, Parra A, Maza F, Navarrete P, Gonzalez M, Latorre M, Toro M, Reyes-Jara A. 2019. The combined effect of cold and copper stresses on the proliferation and transcriptional response of Listeria monocytogenes. Front  Microbiol. 10:612. 
31. Latorre M, Burkhead JL, Hodar C, Arredondo M, González M, Araya M. 2019. Chronic copper treatment prevents the liver critical balance transcription response induced by acetaminophen. J Trace Elem Med Biol. 53:113-119.
32. Campos F, Álvarez JA, Ortiz-Severín J, Varas MA, Lagos CF, Cabrera R, Álvarez SA, Chávez FP. 2019. Fluorescence enzymatic assay for bacterial polyphosphate kinase 1 (PPK1) as a platform for screening antivirulence molecules. Infect Drug Resist. 12: 2237-2242.
33. Vidal E, Moyano T, Bustos B, Pérez-Palma E, Moraga C, Riveras E, Montecinos A, Azocar L, Soto D, Vidal M, Di Genova A, Puschel K, Nürnberg P, Buch S, Hampe J, Allende M, Cambiazo V, Gonzalez M, Hodar C, Montecino M, Muñoz-Espinoza C, Orellana A, Reyes-Jara A, Travisany D, Vizoso P, Moraga M, Eyheramendy S, Maass A, De Ferrari G, Miquel JF, Gutierrez R. 2019. Whole Genome Sequence, Variant Discovery and Annotation in Mapuche-Huilliche Native South Americans. Sci Rep. 9:2132. 
34. Varas MA, Ortíz-Severín J, Marcoleta AE, Santiviago CA, Allende ML, Chávez FP. 2019. Static immersion and injection methods for live cell imaging of foodborne pathogen infections in zebrafish larvae. Methods Mol Biol. 1918: 183-190.
35. Maza F, Maldonado J, Vásquez J, Mandakovic D, Gaete A, Cambiazo V, González M. 2019. Soil bacterial communities from the Chilean Andean highlands: taxonomic composition and culturability. Front Bioeng Biotechnol. 7:10.
36. Fernández-Gómez B, Maldonado J, Mandakovic D, Gaete A, Gutiérrez RA, Maass A, Cambiazo V, González M. 2019. Bacterial communities associated to Chilean altiplanic native plants from the Andean grasslands soils. Sci Rep. 9: 1042. 
37. Mandakovic D, Maldonado J, Pulgar R, Cabrera P, Gaete A, Urtuvia V, Seeger M, Cambiazo V, González M. 2018. Microbiome analysis and bacterial isolation from Lejía Lake soil in Atacama Desert. Extremophiles. 22:665-673 
38. Mandakovic D, Rojas C, Maldonado J, Latorre M, Travisany D, Delage E, Bihouée A, Jean G, Díaz FP, Fernández-Gómez B, Cabrera P, Gaete A, Latorre C, Gutiérrez RA, Maass A, Cambiazo V, Navarrete SA, Eveillard D, González M. 2018. Structure and co-occurrence patterns in microbial communities under acute environmental stress reveal ecological factors fostering resilience. Sci Rep. 8:5875. 
39. Figueroa M, Fernandez V, Arenas-Salinas M, Ahumada D, Muñoz-Villagrán C, Cornejo F, Vargas E, Latorre M, Morales E, Vásquez C, Arenas F. 2018. Synthesis and Antibacterial Activity of Metal(loid) Nanostructures by Environmental Multi-Metal(loid) Resistant Bacteria and Metal(loid)-Reducing Flavoproteins. Front Microbiol. 9: 959. 
40. Latorre M, Quenti D, Travisany D, Singh KV, Murray BE, Maass A, Cambiazo V. 2018. the role of fur in the transcriptional and iron homeostatic response of Enterococcus faecalis. Front Microbiol. 9:1580. 
41. Hodar C, Cambiazo V. 2018. The dorsoventral patterning of Musca domestica embryos: insights into BMP/Dpp evolution from the base of the lower cyclorraphan flies. Evodevo. 9:13. 
42. Marcoleta AE, Varas MA, Ortiz-Severín J, Vásquez L, Berríos-Pastén C, Sabag AV, Chávez FP, Allende ML, Santiviago CA, Monasterio O, Lagos R. 2018. Evaluating different virulence traits of Klebsiella pneumoniae using Dictyostelium discoideum and Zebrafish larvae as host models. Front Cell Infect Microbiol. 8:30.
43. Hart A, Cortés MP, Latorre M, Martinez S. 2018. Codon usage bias reveals genomic adaptations to environmental conditions in an acidophilic consortium. PLoS One. 13: e0195869.
44. Bermúdez L, Del Pozo T, Silvestre Lira B, de Godoy F, Boos I, Romanò C, Previtali V, Almeida J, Bréhélin C, Asis R, Quadrana L, Demarco D, Alseekh S, Salinas Gamboa R, Pérez-Flores L, Dominguez PG, Rothan C, Fernie AR, González M, Stocker A, Hemmerle A, Clausen MH, Carrari F, Rossi MA. 2018. Tomato tocopherol-binding protein sheds light on intracellular α-tocopherol metabolism in plants. Plant Cell Physiol. 59: 2188-2203.
45. Pavez L, Tobar N, Chacón C, Arancibia R, Martínez C, Tapia C, Pastor A, González M, Martínez J, Smith PC. 2017. Chitosan-Triclosan Particles Modulate Inflammatory Signaling in Gingival Fibroblasts. J Periodontal Res. 53: 232-239. 
46. Cortés MP, Mendoza SN, Travisany D, Gaete A, Siegel A, Cambiazo V, Maass A. 2017. Analysis of Piscirickettsia salmonis Metabolism Using Genome-Scale Reconstruction, Modeling, and Testing. Front Microbiol. 8:2462. 
47. Pastenes L, Valdivieso C, Di Genova A, Travisany D, Hart A, Montecino M, Orellana A, Gonzalez M, Gutiérrez RA, Allende ML, Maass A, Méndez MA. 2017. Global gene expression analysis provides insight into local adaptation to geothermal streams in tadpoles of the Andean toad Rhinella spinulosa. Sci Rep. 7:1966.  
48. Palominos MF, Verdugo L, Gabaldon C, Pollak B, Ortíz-Severín J, Varas MA, Chávez FP, Calixto A. 2017. Transgenerational diapause as an avoidance strategy against bacterial pathogens in Caenorhabditis elegans. mBio. 8: e01234-17. 
49. Díaz-Pascual F, Ortíz-Severín J, Varas MA, Allende ML, Chávez FP. 2017. In vivo host-pathogen interaction as revealed by global proteomic profiling of Zebrafish larvae. Front Cell Infect Microbiol. 7: 334. 
50. Varas M, Ortíz-Severín J, Marcoleta AE, Díaz-Pascual F, Allende ML, Santiviago CA, Chávez FP. 2017. Salmonella Typhimurium induces cloacitis-like symptomsin zebrafish larvae. Microb Pathog. 107: 317-320. 
51. Varas M, Valdivieso C, Mauriaca C, Ortíz-Severín J, Paradela A, Poblete-Castro I, Cabrera R, Chávez FP. 2017. Datasets for transcriptomics, q-proteomics and phenotype microarrays of polyphosphate metabolism mutants from Escherichia coli. Data Brief. 12: 13-17.

Red de colaboración

• Dr. Alejandro Maass. Centro de Modelamiento Matemático. Mathomics. Facultad de Ciencias Físicas y Matemáticas. Universidad de Chile.
• Dra. Patricia Águila-Torres. Laboratorio de Microbiología Molecular, Escuela de Tecnología Médica, Universidad Austral de Chile, Puerto Montt, Chile Universidad Austral (UACH)
• Dr. Mario Tello. Laboratorio de Metagenómica Bacteriana, Centro de Biotecnología Acuícola, Facultad de Química y Biología, Universidad de Santiago de Chile.
• Dr. Francisco Chávez. Laboratorio de Microbiología de Sistemas, Departamento de Biología, Facultad de Ciencias, Universidad de Chile.
• Dra. Lorena Pizarro. Laboratorio de Inmunidad Vegetal, ICA3, Universidad de O’Higgins. 
• Dra. Valentina Parra. Laboratorio de Diferenciación Celular y Metabolismo, Facultad de Ciencias Químicas y Farmacéuticas, Universidad de Chile.